À bord du module 77 du JIOR Sphere 01, Haruto Tokishima perd un concours de restauration face à Shōko Sashinami pour l'utilisation de leur terrain d'école alors qu'à leur insu, cinq agents dorsiens infiltrés infiltrent le lycée Sakimori. Quelque temps plus tard, alors que les agents explorent l'école pour une destination, l'un d'eux a une brève altercation avec Haruto sur leurs différentes visions du monde. Ensuite, les agents dorssiens s'infiltrent et tuent les scientifiques dans un laboratoire secret sous l'école bien qu'un scientifique blessé éjecte leur cible principale, un mecha géant appelé Valvrave 01 à la surface de l'école.