После смелого побега из адской панамской тюрьмы Сона братья Майкл Скофилд и Линкольн Берроуз полны решимости добиваться справедливости в борьбе против Компании — скрытой группы, ответственной за разрушение их жизни и убийство женщины, которую любил Майкл, — доктора Сары Танкреди. Стремление Майкла к мести приводит его в Лос-Анджелес, где его мир переворачивается с ног на голову, когда ему сообщают, что Сара всё ещё жива. Понимая, что они действительно будут свободны, Майкл и Линкольн обещают найти Сару и уничтожить Компанию. С помощью агента внутренней безопасности Дона Селфа они собирают группу союзников и знакомых лиц для выполнения своей задачи: Махоуни, Сукре, Беллик и компьютерный эксперт Роланд Гленн. К сожалению для братьев, они также должны уклониться от убийцы Компании Уайетта и найти Ти-Бэга. Майкл и Линкольн вскоре обнаруживают, что единственное, что сложнее, чем вырваться, это взломать.