Dr. Drakkens försök att skapa en armé av genetiskt förbättrade supersoldater misslyckas eftersom han inte riktigt behärskar tekniken. Men genom att samarbeta med genetikern Amy ”DNAmy” Hall tror Drakken att han ska kunna lösa problemen. I skolan i Middleton handlar det också om samarbete när eleverna ska arbeta parvis med olika vetenskapsprojekt. Ron Stoppable ska arbeta tillsammans med Monique, och Kim får det unga geniet Justine Flanner som partner. Personkemin i grupperna stämmer inte alls, men så anfalls staden av Drakkens och DNAmys jättelika dinosaurie och då kommer saken i ett annat läge.